ダイズやばれいしょ、かんしょ、そばは代表的な畑作物です。日本の食卓に欠かせないと同時に、土地利用型農業にとっても欠かせない作物です。これらの畑作物のゲノム構造はイネと比べると複雑な構造をしていますが、ゲノム情報が整備されつつあります。そのような情報を利用して、さらには独自にゲノム情報を整備して、生産性やストレス耐性、病害虫抵抗性に関わる遺伝子を明らかにします。そして、生産者や消費者のニーズに合わせて高品質で生産性が高い品種を短期間で開発する新しい品種育成システムを構築します。