農業生物資源研究所 - プレスリリース - オオムギで働く2万個以上の遺伝子配列を決定

- ムギ類の品種改良への貢献に期待 -

ポイント

オオムギの24,783個の遺伝子について塩基配列を決定しました。

このうち、85%のオオムギ遺伝子の機能を推定しました。

ムギ類の品種改良への利用が期待されます。

概要

（独）農業生物資源研究所（生物研）は、岡山大学資源植物学研究所および日立公共システムエンジニアリング株式会社と共同で、オオムギにおける17万個以上の完全長cDNA¹⁾を収集し、そのうち重複を除いた24,783個のcDNA（＝遺伝子）について塩基配列を決定しました。

様々な生物から既知の遺伝子情報を収集したデータベースと照合することで、配列を決定したオオムギ遺伝子のうちの85%について機能を推定しました。今回の結果は、データベース The barley full length cDNA database (http://barleyflc.dna.affrc.go.jp/hvdb/index.html) として公開しました。

また、オオムギ独自の特徴を決定していると予想される他の穀物（イネ、トウモロコシ、ソルガムなど）がもたない遺伝子1,699個を発見しました。

これらオオムギの遺伝子情報は、オオムギのみならず、ムギ類全般の品種改良に活用できると期待されます。

予算区分：

参考資料 [PDFファイル：226キロバイト]

Takashi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka, Hiroaki Sakai, Naoki Amano, Hiroyuki Kanamori, Kanako Kurita, Ari Kikuta, Kozue Kamiya, Mayu Yamamoto, Hiroshi Ikawa, Nobuyuki Fujii, Kiyosumi Hori, Takeshi Itoh and Kazuhiro Sato
Comprehensive Sequence Analysis of 24,783 Barley Full length cDNAs derived from Twelve Clone Libraries
Plant Physiology 156：20-28 (2011) doi:10.1104/pp.110.171579 OPEN ACCESS ARTICLE

Klaus F.X. Mayer, Mihaela Martis, Pete E. Hedley, Hana Šimková, Hui Liu, Jenny A. Morris, Burkhard Steuernagel, Stefan Taudien, Stephan Roessner, Heidrun Gundlach, Marie Klaus F.X. Mayer, Mihaela Martis, Pete E. Hedley, Hana Šimková, Hui Liu, Jenny A. Morris, Burkhard Steuernagel, Stefan Taudien, Stephan Roessner, Heidrun Gundlach, Marie Kubaláková, Pavla Suchánková, Florent Murat, Marius Felder, Thomas Nussbaumer, Andreas Graner, Jerome Salse, Takashi Endo, Hiroaki Sakai, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Itoh, Kazuhiro Sato, Matthias Platzer, Takashi Matsumoto, Uwe Scholz, Jaroslav Doležel, Robbie Waugh, and Nils Stein
Unlocking the Barley Genome by Chromosomal and Comparative Genomics
The Plant Cell 23: 1249-1263 (2011) doi:10.1105/tpc.110.082537 OPEN ACCESS ARTICLE

問い合わせ先など

研究代表者：

(独)農業生物資源研究所理事長

石毛光雄

研究推進責任者：

(独)農業生物資源研究所農業生物先端ゲノム研究センター

作物ゲノム研究ユニットユニット長

松本隆

電話番号：029-838-7441、電子メール：mat@nias.affrc.go.jp

研究推進責任者：

(独)農業生物資源研究所農業生物先端ゲノム研究センター

ゲノムインフォマティックスユニットユニット長

伊藤剛

研究推進責任者：

岡山大学資源植物学研究所教授

佐藤和広

研究責任者：

(独)農業生物資源研究所農業生物先端ゲノム研究センター

ゲノムインフォマティックスユニット主任研究員

田中剛

研究責任者：

日立公共システムエンジニアリング株式会社

新事業開発本部アプリケーション・ソリューション部

藤井信之

広報担当者：

(独)農業生物資源研究所広報室長

小川泰一

電話番号：029-838-8469

【掲載新聞】 8月10日水曜日：茨城新聞、8月11日木曜日：日本農業新聞、化学工業日報、8月16日火曜日：日経産業新聞